应用PCR-DGGE 和Q-PCR 分析不同体重斑点叉尾皮肤、鳃和胃肠道菌群结构
作者:
作者单位:

1. 四川农业大学 动物医学院, 四川 成都 611130;2. 四川省水产学校, 四川 成都 611730;3. 雅安市农业局, 四川 雅安 625000

作者简介:

孙豪(1990), 男, 硕士研究生, 从事动物微生态研究. E-mail: sunhaolsyd@163.com

中图分类号:

S941

基金项目:

四川省科技厅科技支撑项目(2013NZ0042).


Application of PCR-DGGE and Q-PCR to analyze microflora of skin, gills, and the gastrointestinal tract of Ictalurus punctatus with different weights
Author:
Affiliation:

1. College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China;2. Sichuan Fishery School, Chengdu 611730, China;3. Ya’an City Bureau of Agriculture, Ya’an 625000, China

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    摘要:

    采用聚合酶链式反应变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量娢合酶链式反应(Q-PCR)技术分析高体重(high weight, HW)和低体重(low weight, LW)斑点叉尾(Ietalurus punetaus)皮肤、鳃和胃肠道菌群多样性, 为斑点叉尾微生态研究及筛选斑点叉尾源益生菌提供理论依据。结果显示, 斑点叉尾菌群丰富度由低到高依次为鳃、皮肤、前肠、后肠和胃。肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和气单胞菌属(Aeromonas)是皮肤的优势菌群; 肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、气单胞菌属(Aeromonas)和肠球菌属(Enterococcus)是水体、鳃和胃的优势菌群; 肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、拟杆菌属(Bacteroidetes)、气单胞菌属(Aeromonas)和酵母菌属(Saccharomyces)是肠道的优势菌群。HW 斑点叉尾鳃菌群的香农多样性指数、均匀度和丰富度及前肠菌群的丰富度显著高于LW 斑点叉尾(Pヰ.05)。皮肤的黄杆菌属(Flavobacterium), 胃的肠杆菌科(Enterobacteriaceae), 前肠的拟杆菌属(Bacteroidetes)和双歧杆菌属(Bifidobacterium)及后肠的拟杆菌属(Bacteroidetes)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)和酵母菌属(Saccharomyces)的拷贝数分别是101.97、107.69、106.19、103.83、106.13、103.92 和104.26, 均显著高于LW 斑点叉尾(Pヰ.05)。结果表明, 斑点叉尾皮肤、鳃、胃肠道均形成独特的菌群结构, LW 和HW 斑点叉尾菌群结构存在明显差异, HW斑点叉尾菌群多样性增加。

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

孙豪,时云朵,倪学勤,刘倩,曾东.应用PCR-DGGE 和Q-PCR 分析不同体重斑点叉尾皮肤、鳃和胃肠道菌群结构[J].中国水产科学,2017,24(1):156-164
SUN Hao, SHI Yunduo, NI Xueqin, LIU Qian, ZENG Dong. Application of PCR-DGGE and Q-PCR to analyze microflora of skin, gills, and the gastrointestinal tract of Ictalurus punctatus with different weights[J]. Journal of Fishery Sciences of China,2017,24(1):156-164

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  • 在线发布日期: 2017-01-12
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