大黄鱼cGPDH和mGPDH基因克隆及低温胁迫下的表达差异分析
CSTR:
作者:
作者单位:

作者简介:

张东玲(1977–),女,副教授,研究方向为水生生物学.E-mail:zhangdongling@jmu.edu.cn

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:

国家自然科学基金重点项目(U1705231); 福建省自然科学基金项目(2019J01692); 福建省教育厅项目(JT180274); 福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室开放课题资助项目(2015fjxcq07); 厦门市科技计划项目(3502Z20193052).


Molecular cloning of cGPDH and mGPDH and their expression analysis under low-temperature stress in Larimichthys crocea
Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    为探究 cGPDH 和 mGPDH 在大黄鱼(Larimichthys crocea)适应低水温过程中所起的调控作用, 本研究采用 RACE-PCR 技术克隆了大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 基因全长 cDNA 序列, cGPDH 和 mGPDH 基因序列全长分别为 1577 bp 和 2319 bp, 包含长度为 1050 bp 和 2193 bp 的开放阅读框, 分别编码 349 和 730 个氨基酸; 氨基酸比对分析发现大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 与其他硬骨鱼类同源性较高, cGPDH 包含一个特征性序列 GXGXXG, mGPDH 包含 2 个 EF-hand 功能结构域; 进化树分析表明大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 与其他硬骨鱼类聚为一枝, 与棘头梅童鱼 (Collichthys lucidus)亲缘关系最近。生物信息学分析发现大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 均不含跨膜结构域, cGPDH 亚细胞定位于细胞质可能性最大, 三维结构包含一个 C 端 α 螺旋底物结合结构, 8 个 N 端 β 折叠结构和一个单体结构, mGPDH 定位于线粒体的可能性最大。qRT-PCR 分析显示 cGPDH 和 mGPDH 在所检测的 12 个组织中均有表达, cGPDH mRNA 主要表达在血液, 其次为鳃、头肾和肠道, 肌肉组织中表达量最低; 而 mGPDH mRNA 在头肾表达量最高, 肌肉组织表达量最低。在持续的冷胁迫下, 水温 15 ℃到 9 ℃每天降温 2 ℃, 9 ℃到 7 ℃每天降温 1 ℃, 7 ℃保持 5 d, 大黄鱼 cGPDH 和 mGPDH 在脑和肌肉表达趋势均显著上调。研究结果表明, cGPDH 和 mGPDH 基因可能在大黄鱼适应冬季低水温过程中发挥重要作用。

    Abstract:

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

张东玲,徐浩,张震西,王志勇.大黄鱼cGPDH和mGPDH基因克隆及低温胁迫下的表达差异分析[J].中国水产科学,2021,28(3):253-264
Zhang Dongling, Xu Hao, Zhang Zhenxi, Wang Zhiyong. Molecular cloning of cGPDH and mGPDH and their expression analysis under low-temperature stress in Larimichthys crocea[J]. Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(3):253-264

复制
分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2021-03-31
  • 出版日期:
文章二维码