为探究刀鲚(Coilia nasus)内皮素 1 (endothelin 1, Edn1)基因对刀鲚上颌骨长度的影响, 根据此前的基因组重测序结果以及刀鲚基因组数据库, 通过 PCR 扩增得到刀鲚 Edn1 基因序列, 并使用直接测序法筛选并分析单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点, 分析各位点的基因型, 并计算各位点的基本遗传参数、基因型频率和基因频率, 将筛选出的 SNP 位点与刀鲚上颌骨长度性状进行关联分析、连锁不平衡分析和双倍型分析。结果表明, 在刀鲚 Edn1 基因中共挖掘出 5 个 SNP 位点, 分别为 T134C、A418C、G1322A、C1607T、A1636C。G1322A 与 A1636C 两个位点之间处于连锁不平衡状态。关联分析结果显示, T134C 位点和 A418C 位点与上颌骨长度性状之间存在显著相关性; 双倍型分析结果显示, T134C 位点和 A418C 位点组成的双倍型中, D3 (杂合 TC 和纯合 AA)的上颌骨长度显著长于 D1 (纯合 TT 和杂合 AC)和 D2 (纯合 TT 和纯合 CC)。此外, 刀鲚开口高度/头长和上颌骨长/ 头长的皮尔逊相关系数 r=0.41, 属中等正相关。研究结果表明, T134C 位点和 A418C 位点是刀鲚上颌骨长度的优势位点, 双倍型 D3 为优势基因型。本研究可为刀鲚长颌骨分子标记辅助选育的候选标记提供科学依据。