为明确牙鲆(Paralichthys olivaceus) foxl3 的结构和功能, 通过 PCR 克隆和测序获得了牙鲆 foxl3 的编码区 (coding sequence, CDS)和 3ʹ非编码区(untranslated region, UTR), 共 1089 bp, 其中开放阅读框(open reanding frame, ORF) 750 bp, 编码 249 个氨基酸。Foxl3 二级结构包含一个 FH (Forkhead)结构域; 三级结构则包含 20.48%的 α 螺旋、15.26%的延伸链和 64.26%的无规则卷曲, 不均匀分布在蛋白多肽链上。比较多种生物 Foxl3 氨基酸序列发现, 牙鲆 Foxl3 与其他鱼类相似度较高, 其中与大菱鲆(Scophthalmus maximus)同源性最高, 达到 91.97%, 与斑马鱼 (Danio rerio)的同源性最低, 仅为 66.27%。通过氨基酸序列比对发现, 与 Foxl2 相比, Foxl3 在不同物种之间的差异更为显著, 说明 foxl3 的进化速度比 foxl2 快。亚细胞定位显示, Foxl3 细胞融合蛋白在细胞核和细胞质中表达。实时荧光定量 PCR 检测结果显示 foxl3 在牙鲆卵巢中表达量最高, 显著高于精巢等其他组织, 暗示 foxl3 可能在牙鲆卵巢发育与分化中具有重要意义。