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首页 > 过刊浏览>2011年第18卷第4期 >782-789
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海参DNA条形码的构建及应用
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作者:
作者单位:

中国海洋大学 食品科学与工程学院,

作者简介:

律迎春(1988-), 男, 硕士研究生, 研究方向为水产品质量监督与控制. E-mail: oasis0212@163.com

通讯作者:

中图分类号:

Q959

基金项目:

海洋公益性行业科研专项(201105029); 国际科技合作项目(2010DFA31330);“泰山学者”建设工程专项经费资助项目(JS200510013); 浙江省重大科技专项(2008C2009).


Construction and application of DNA barcoding in sea cucumber Holothurians 
Author:
Affiliation:

College of Food Science and Engineering, Ocean University of China

Fund Project:

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    摘要:

    氧化酶亚基COⅠ)条形码鉴定海参品种的可行性不同海参之间的种间遗传距离和种内遗传距离邻接法和最大简约法分别构建了分子系统树。结果表明海参的种间遗传距离显著大于种内遗传距离不同海参在系统树中分别形成各自独立的分支以作为海参条形码进行品种鉴定具有一定的可行性。在建立海参)种海参ApostichopusCucumariafrondosa及该探针具有较好的特异性和较高的灵敏度的研究奠定了

    Abstract:

    DNAbarcodingisadiagnostictechniqueinwhichshortDNAsequencescanbeusedforspeciesidentification.ThemitochondrialcytochromecoxidasesubunitI()sequenceisusedinDNAbarcodingforspeciesidentificationinmanyorganisms.Inthispaper,thevalidationofthegenesfromsevenspeciesofseacucumberswereamplifiedandsequenced.DatawereanalyzedusingDNAstar,DNAMAN,andMEGA4.1.TheDNAbasecompositionwasanalyzed,andthegeneticvariationsamongspeciesandwithinspecieswerecalculated.Itwasfoundthatthegeneticdistanceamongthesevenspecieswashigherthanthatwithinaspecies.Phylogeneticanalysisusingneighbor-joiningandmaximumparsimonymethodsgeneratedtreetopologiesthatindicatedthatallindividualsofeachspeciesformedastrongmonophyleticgroup.TheseresultssuggestedthatthemitochondrialgenewasavalidDNAbarcodinggeneforspeciesidentificationinseacucumbers.OnthebasisoftheDNAbarcoding,species-specificprobesofweredesigned.Dot-blothybridizationshowedthattheprobescouldidentifywithhighspecificityandsensitivity.Thedesignoffurtherprobesfordifferentseacucumberspecies,combinedwithdot-blothybridizationandmicrochipassays,willfacilitatetheidentificationofseacucumbersatrelativelylowcosts.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

律迎春,左涛,唐庆娟,段高飞,王春霞,李晋,徐洁,薛长湖.海参DNA条形码的构建及应用[J].中国水产科学,2011,18(4):782-789
LU Yingchun, TANG Qingjuan, ZUO Tao, DUAN Gaofei, WANG Chunxia, LI Jin, Xu Jie, Xue Changhu. Construction and application of DNA barcoding in sea cucumber Holothurians [J]. Journal of Fishery Sciences of China,2011,18(4):782-789

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  • 在线发布日期: 2011-08-16
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