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福尔马林固定鱼类标本DNA提取方法的优化
作者:
作者单位:

1. 中国水产科学研究院 南海水产研究所, 农业部南海渔业资源开发利用重点实验室, 广东 广州 510300; 2. 上海海洋大学 水产与生命学院, 上海 201306

作者简介:

孔啸兰(1986), 女, 硕士研究生, 研究方向: 渔业生态保护. E-mail: weilankong.2005@163.com

中图分类号:

Q173

基金项目:

广东省重大科技计划项目(2009B030600002); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2010ZD01, 2011YD03); 广东省科技计划项目(2011B031100001); 广东省自然科学基金资助项目(9451030002002475).


Optimization of genomic DNA extraction from formalin-fixed fish specimens 
Author:
Affiliation:

1. South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510300, China; 2. College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China

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    摘要:

    气候变化和人类活动胁迫致使许多海洋鱼类种群结构发生了显著变化。为了摸清鱼类种群结构对气候变化和人类胁迫活动的响应机理是一种有效的途径。为了解决福尔马林固定鱼类样本)研究提取产量的影响。以取样部位、除甲醛处理、消化时间、抽提方法为考察因素4

    Abstract:

    Inrecentdecades,thepopulationstructureofmanymarinefishhasdramaticallychangedundertheinfluenceofanthropogenicactivitiesandclimatechange.Tobetterunderstandthechangemechanism,DNAextractedfromformalin-fixedmarinefishspecimensisrequired.However,obtaininghighqualityDNAfromformalin-fixedspecimensisdifficult.Toobtainknowledgeforspecimensthatwerefixedin1962wereusedassamples,andanorthogonalexperimentwasdesignedfollowingtheL)table.TheDNAconcentrationwastakenastheevaluationindex.Thetissuetypes,anti-formaldehydetreatments,digestivetimesandextractionmethodsweretakenasselectionfactors.Thebestgroupwasdeterminedtobe℃anddryinginavacuumcentrifuge,3hofdigestionwithProteinaseKwithinawaterbathof55,andDNAextractionbykit.Anti-formaldehydetreatmentssignificantlyimprovedtheproductionofDNAandtheuseofvariousanti-formaldehydemethodsobtainedthebesteffect.Digestionaftera90DNAwasassessedbyPCRamplificationandsequencingthemethods

    参考文献

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    [24] 

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引用本文

孔啸兰,陈作志,林琳,李纯厚,梁沛文.福尔马林固定鱼类标本DNA提取方法的优化[J].中国水产科学,2012,19(6):1068-1073
KONG Xiaolan, CHEN Zuozhi, LIN lin, LI Chunhou, LIANG Peiwen. Optimization of genomic DNA extraction from formalin-fixed fish specimens [J]. Journal of Fishery Sciences of China,2012,19(6):1068-1073

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  • 在线发布日期: 2012-11-21
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