东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)是我国近海一种主要的赤潮生物。前期研究证明不同环境条件下其生长速度也有所不同。为研究不同增殖速度的东海原甲藻细胞周期时相分布特点以及内在调控机理,本文通过利用流式细胞术比较两种不同增殖速度的东海原甲藻细胞的细胞周期时相差异并利用RNA-seq技术对两组细胞进行转录组测序及比较分析。结果显示：相比增殖速度较快的实验组,增殖速度较慢的实验组S期缩短,且部分细胞阻滞在G2/M期。因此,S期的持续时间和G2/M期转换是否被阻滞可以决定东海原甲藻的增殖速率。两实验组差异表达基因富集程度最大且富集最显著的GO分类均与微管和细胞骨架有关,暗示两实验组细胞周期进程的差异由细胞中的微管动态变化不同造成。注释到50个细胞周期蛋白编码基因、77个周期蛋白依赖性激酶编码基因和30个细胞分裂控制蛋白编码基因,其中有10个差异表达基因,包括CyclinA、G2/mitotic-specific CyclinB、CyclinU、CDK1、CDK2、Cdc2、Cdc48。这些差异表达基因在调节东海原甲藻细胞S期和G2/M期调节中起到重要的作用。