糖原是影响牡蛎品质的关键指标，而糖原脱支酶（AGL）在糖原分解过程中发挥重要作用。为明确AGL基因对近江牡蛎（Crassostrea ariakensis）糖原代谢的影响，本研究在分析AGL基因序列特征和进化特点基础上，体外构建含有该基因的质粒并转化到HT115（DE3）大肠杆菌（Escherichia coli）中，使其表达AGL基因的双链RNA（dsRNA），通过饲喂该菌株实现RNA干扰，并对干扰前后近江牡蛎AGL基因表达量和糖原含量的相关性进行了研究。结果表明，AGL基因编码区序列长度为4719 bp，编码1572个氨基酸，含4个结构域，预测蛋白分子量为178.23 kDa，理论等电点为6.21，基因进化关系与物种传统分类关系一致；RNA干扰15 d和30 d，与对照组（饲喂含EGFP dsRNA的大肠杆菌）相比，实验组（饲喂含AGL dsRNA的大肠杆菌）牡蛎的AGL基因表达量均显著降低（P < 0.05），糖原含量显著升高（P < 0.05），干扰AGL基因能够显著影响到糖原水平的变化；干扰30 d，实验组和对照组牡蛎AGL表达量比干扰15 d时均显著增加（P < 0.05），糖原含量显著降低（P < 0.05），这可能是由于此时期性腺发育需要消耗糖原所致；同时，进一步的相关性分析结果表明AGL基因表达量与糖原含量呈显著负相关关系（P < 0.05）。本研究明确了近江牡蛎AGL基因序列结构特征以及其表达量与糖原含量的相关性，丰富了AGL基因功能研究的科学数据，为深入研究牡蛎糖原代谢的分子机制提供了参考。