拟穴青蟹CA基因SNPs位点筛选及耐低盐关联分析
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作者单位:

1.上海海洋大学;2.中国水产科学研究院东海水产研究所

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基金项目:

国家重点研发计划(2024YFD2401703),中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2023TD31), 现代农业产业技术体系专项(CARS-48)


Identification of SNPs in the CA gene of Scylla paramamosain and association analysis with low-salinity tolerance
Author:
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Shanghai Ocean University

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    为探究盐度相关基因的SNP位点与耐低盐性状的关联性,本研究以拟穴青蟹为研究对象,从碳酸酐酶(CA)基因中筛选SNP位点并进行耐低盐关联分析。用于SNP位点筛选的样本来自4个拟穴青蟹野生群体,从CA基因中初筛共获得56个SNP位点,选取4个位点(A13938G、T13981C、A18286G、C18336T)进行分型分析。结果显示,4个位点的突变型基因型频率在耐低盐组中均显著高于不耐低盐组(p < 0.05);遗传多样性分析表明,耐低盐组在各位点的观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量和有效等位基因数均高于不耐低盐组;,4个位点的优势比(OR)均大于1,与耐低盐性状正关联。进一步对4个位点进行联合分析发现,耐低盐组的突变总得分显著高于不耐低盐组(p < 0.05),且随着位点数量增加,预测准确率逐步提升至96.25%,表明多个突变位点可能通过协同作用影响耐低盐性状。综上,A13938G、T13981C、A18286G、C18336T等位点可作为拟穴青蟹耐低盐性状候选分子标记,在耐低盐新品种选育方面具有重要的潜在应用价值。

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  • 收稿日期:2025-07-30
  • 最后修改日期:2025-08-24
  • 录用日期:2025-09-02
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