窦亚琪 , 梁旭方 , 高俊杰 , 何珊 , 石林杰 , 史登勇
2020, 27(5):485-493.
摘要:以鳜()选育群体为实验材料,在易驯食与不易驯食鳜转录组Unigene数据库中共预测到4809个SNP位点,其中胃蛋白酶基因(pepsinoge,)均为转录组筛选获得的鳜驯食性状候选基因,本研究将候选基因上的多态SNP位点在易驯食和不易驯食鳜群体中进行基因分型,并与鳜驯食性状进行关联分析。在易驯食与不易驯食的鳜群体中共发现5个单核苷酸(SNP)多态性位点,有效等位基因(e)分别分布于0.1800~0.3585和0.1655~0.4160,多态信息含量(PIC)为0.2477,全部位点都属于中度多态性位点。结果表明SNP位点<0.05),组合得到的3种基因型Genotype1(CT,CC/CT/TT,AA,AA,TT)、Genotype2(TT,CC/CT/TT,AA,AA,TT)和Genotype3(TT,CC,AA,AA,TT)也与鳜驯食性状呈高水平显著相关(gh基因中鉴定出与驯食性状呈显著关联的SNP分子标记,为加快易驯食鳜新品种的基因辅助选育提供有效的SNP分子标记。
邝杰华 , 马骞 , 毛非凡 , 李昂 , 刘新富 , 周启苓 , 庄志猛
2020, 27(5):494-503.
摘要:为了探究小分子热休克蛋白基因)应对低盐胁迫过程中的调节作用,本研究基于前期转录组数据,获取3个目标基因的序列信息并进行了系统进化分析,利用实时荧光定量PCR技术检测了3个基因在两种低盐胁迫处理下不同时间点(0 h、12 h、24 h和48 h)在鳃、肠、肾和肝组织中的表达水平。系统进化分析结果表明,基因分别聚类形成独立分支;在各基因分支中,松江鲈与已报道的鲈形目、鲤形目和鳉形目等鱼种共同聚为硬骨鱼类分支。在两种低盐胁迫处理下,3个基因在鳃组织中的表达量均在12 h显著升高,而在肠、肾和肝组织中的表达量则呈现不同的变化趋势。肠组织中,表达量在48 h显著降低;盐度骤变低盐胁迫(盐度变化速率27/h)下HSPB7和HSPB11表达量则显著升高。肝组织中,表达量在两种处理下均显著升高。本研究比较分析了基因在松江鲈应对不同低盐胁迫时表达变化规律的异同,相关结果为探讨小分子热休克蛋白在鱼类应激调节过程中的作用及洄游性鱼类适应盐度变化的分子调控机制提供了理论依据。
2020, 27(5):504-515.
摘要:为了解下丘脑神经肽(kisspeptin)在施氏鲟()生殖调控中的作用,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和RACE技术首次克隆得到施氏鲟2个kisspeptin基因的全长cDNA序列,命名为基因的cDNA全长为522 bp,编码130个氨基酸;基因的cDNA全长为518 bp,编码149个氨基酸;Kiss1和Kiss2均以α-螺旋和无规则蜷曲为二级结构中的主要元件,且为含有信号肽、无跨膜结构、分泌到细胞外的不稳定亲水性蛋白质。氨基酸序列比对及进化分析表明,施氏鲟Kiss1和Kiss2具有高度保守区域,与达氏鲟(和在早期性腺发育过程中的表达量检测显示,在孵化后0~49 d,kiss2的表达水平逐渐升高并在139 d达到最高,随后下降;与的表达量在孵化后184 d达到峰值。以上结果表明,kisspeptin基因在施氏鲟早期性腺发育过程中具有重要的作用,且其调控功能存在差异。本实验为进一步阐明的生理功能和分子调控机制奠定了理论基础。
2020, 27(5):516-523.
摘要:研究了淡水珍珠贝——三角帆蚌()在不同蚌龄下外套膜组织的细胞增殖及生物矿化相关因子活性。选择5组不同蚌龄三角帆蚌(0.5龄、1龄、2龄、3龄、4龄),通过流式细胞技术分析了外套膜细胞的增殖指数(proliferation index,PrI)和胞内Ca2+浓度,并应用实时荧光定量PCR检测了与生物矿化相关的碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)基因的表达并测定其酶活性。结果表明,2龄蚌的外套膜细胞PrI及胞内Ca2+浓度显著高于其他蚌龄(<0.05),<0.05)。本研究旨为深入探讨三角帆蚌外套膜细胞增殖能力及人工育珠过程中供体蚌的选择奠定基础。
韩星星 , 叶坤 , 王志勇 , 陈丰林 , 柴志强 , 詹炜 , 王秋荣
2020, 27(5):524-535.
摘要:本实验旨在探讨脱脂黑水虻()幼鱼生长、体成分、血清生化指标及抗氧化能力的影响。实验设计6组等氮(粗蛋白45%)等脂(粗脂肪10%)饲料,用黑水虻脱脂虫粉分别替代饲料中0%、20%、40%、60%、80%和100%的鱼粉蛋白,分别记为G0、G20、G40、G60、G80和G100。选用2160尾平均体重为(50.08±3.31)g的大黄鱼幼鱼随机分为6组,每组3个重复,每个重复120尾,在室内水泥池(2 m×1 m×1 m)进行为期7周的投喂实验。结果表明:(1)G100组大黄鱼幼鱼存活率显著低于其他实验组,G40组大黄鱼增重率(WGR)、蛋白质效率(PER)均显著高于其他组(<0.05);肌肉的粗脂肪和粗灰分含量则随DBSFLM替代FM水平的增加而升高,其中替代60%及以上鱼体粗脂肪和粗灰分含量显著升高(<0.05),甘油三酯(TG)和胆固醇(CHOL)水平显著下降(<0.05);(4)G20组大黄鱼肝脏总抗氧化能力(T-AOC)及G40组实验鱼肝脏超氧化物歧化酶(SOD)活性均为最高,G40组大黄鱼肝脏丙二醛(MDA)含量最低。过氧化氢酶(CAT)活性随着DBSFLM替代FM水平升高呈现下降趋势,替代40%及以上CAT活性显著下降(<0.05)。综上所述,在本实验条件下,脱脂黑水虻虫粉替代饲料中40%鱼粉蛋白对大黄鱼幼鱼的生长性能、体成分及健康状况无负面影响。
谢晓 , 张辉 , 孙立元 , 蔡志宇 , 王恒 , 霍来江 , 危起伟
2020, 27(5):536-546.
摘要:目标强度(target strength,TS)是将回波积分值转换成绝对资源量的关键参数,同时也是渔业声学技术的热点研究内容。2012年12月及2013年6-7月,在三峡水库中华鲟基地网箱内使用BioSonics DT-X(199 kHz)分裂波式科学回声仪测定了4种共计31尾不同鳔室构造和体型的长江淡水鱼类背腹方向的目标强度,并将此结果与基尔霍夫近似模型法测定结果进行比较。实验鱼包括鳊(Silurus asotus)10尾及长江鲟()7尾。结果表明,模型法测定结果与网箱控制法所测结果无显著性差异。构建4种鱼TS值(dB)与体长(BL,cm)的标准方程分别为鳊:TS=20lg(BL)-70.1(=0.80);鲇:TS=20lg(BL)-74.5(=0.94)。模型法获得实验鱼目标强度的分布表明,鱼类不同的形态学特征及鳔室数量会影响目标强度的大小与分布特征。低频(38 kHz)下鳊、鲇及长江鲟目标强度最大值对应的姿态倾角出现在-10°~0°,而鲢目标强度最大值出现在-20°~-10°,且不同种类鱼的目标强度最大值所对应姿态倾角的位置各不相同。本研究通过网箱控制法和模型法测定了4种不同鳔室构造和体型的长江淡水鱼类目标强度,可为长江淡水鱼类目标强度研究提供有益借鉴,为采用渔业声学方法进行长江淡水鱼类垂直原位监测评估资源量提供相关参数。
2020, 27(5):547-558.
摘要:于2011年5-10月对莱州湾渔业资源与栖息环境进行了6个航次的逐月大面调查,研究了春末至秋中网采浮游植物群落结构的演替,并利用广义可加模型分析了其与主要小型中上层鱼类资源密度的关系。共记录浮游植物33属78种,总丰度在春、秋季各出现1个峰值,分别为265×104 ind/m3和111×104ind/m3。春末夏初优势种主要为具槽帕拉藻(Coscinodiscus)、角毛藻()属逐渐形成优势。夏末至秋中,物种丰富度、多样性和均匀度皆呈现上升的趋势。将环境和浮游植物群落指标作为解释变量逐步优化后的广义可加终模型,对4种鱼类CPUE总偏差的累积解释率达到了76.5%,月份、海表温度、夜光藻丰度、圆筛藻丰度、甲/硅藻比5个预测变量皆达到显著水平以上,甲/硅藻比的升高对渔业资源密度分布表现出正向的作用。结果表明,莱州湾浮游植物群落长期演变后的类群结构和丰度水平,对鱼类群落结构及其资源量现状的可持续性有着积极的意义。本研究为深入探讨渔业种群关键栖息地早期补充和食物网过程的影响因素,从浮游植物饵料基础变动的角度提供了数据资料和科学依据。
2020, 27(5):559-569.
摘要:流场效应是人工鱼礁发挥其生态效应的基础,流场效应强弱受单位鱼礁规模影响,同时是衡量人工鱼礁建设模式优劣与规划人工鱼礁建设模式的重要参考因素,流场体积是表征流场效应强弱的重要指标。本研究基于数值实验方法,分析米字型人工鱼礁在4种布设模式下28种单位鱼礁规模的流场体积变化规律,并建立上升流、背涡流流场体积与人工鱼礁建设规模指标的多元非线性模型。结果表明,单位鱼礁建设一级指标投放量()与上升流体积分别呈线性、三次函数及幂函数关系,建立上升流体积回归模型为-0.055u-1.833+0.227为0.957,相对误差为18.61%。与背涡流体积分别呈幂函数、三次函数及指数函数关系;结合单位鱼礁建设二级指标相对边长(Ru×(-0.543R2+75.045Ru+1.620为0.938,相对误差为10.09%。该流场体积回归模型可用于规划指导均匀布设模式的人工鱼礁建设,为"减量增质提效"的人工鱼礁建设策略提供参考。
陈锦辉 , 王学昉 , 田思泉 , 高春霞 , 麻秋云 , 刘志豪
2020, 27(5):570-578.
摘要:大眼金枪鱼()作为一种具有极高经济价值的公海金枪鱼捕捞对象,其资源状况和管理情况一直受到学者的高度关注,而对其生活史特征,尤其是生长特征的研究,是对大眼金枪鱼进行准确资源评估和合理养护管理的基础和关键部分。本研究基于中国科学观察员于2013-2018年收集的印度洋大眼金枪鱼生物学数据,通过体长-体重关系研究其生长特征,并运用线性混合效应模型分析其生长特征在不同年份、季度和海域间的差异。依据收集的8806尾大眼金枪鱼样本,求得其上颌叉长FL和加工重量GT(去掉鳃、尾鳍和内脏后的重量)之间的幂函数关系式,其中条件因子的估计值(95%置信区间)为3.08(3.07~3.10)。本研究构建了7个不同异质性组合的混合效应模型,AIC值和均方根误差值均表明同时考虑年份、季度和区域差异的模型拟合效果最佳。最佳模型的结果表明,印度洋15°S以南和以北海域的大眼金枪鱼个体生长特征差异极小,北部个体仅略重于南部个体;相比于第三和第四季度,相同体长的大眼金枪鱼在第一和第二季度具有更多的重量;2015年和2016年采集的个体在同样体长时体重更重,而2014年和2017年的大眼金枪鱼体重比其他年份更轻。本研究结果旨在为大眼金枪鱼的资源评估及渔业管理提供基础资料,异质性的研究方法也可以应用于其他近海、远洋渔业种类的生活史特征、种群特征和资源评估研究。
2020, 27(5):579-588.
摘要:根据1950-2016年的渔获量数据及1955-2016年的单位捕捞努力量(Catch Per Unit Effort,CPUE)数据,采用贝叶斯状态空间剩余产量模型框架JABBA(Just Another Bayesian Biomass Assessment)对印度洋大眼金枪鱼()的资源状况进行评估,分析了渔船效应、CPUE数据尺度对评估结果的影响。结果表明,模型拟合效果对于不同时间跨度下CPUE数据的选择比较敏感。当选用时间跨度为1979-2016年的CPUE数据且考虑渔船效应时,模型拟合效果最好。2016年大眼金枪鱼的资源量为812 kt,最大可持续产量(Maximum Sustainable Yield,MSY)为163 kt,远高于同年渔获量86.81 kt,其资源量具有82.50%的概率处于"健康"状态。当总允许可捕量为69.45~104.17 kt时(2016年渔获量的80%~120%),未来10年大眼金枪鱼的资源量仍高于(达到MSY所需的生物量)。回顾性分析结果表明,该资源评估结果存在一定程度的回顾性问题,捕捞死亡率和资源量分别存在被低估和高估的现象。将来需要在模型结构设定、CPUE数据选择及模型参数的先验分布设置等方面进一步优化。
冯晓婷 , 张桂宁 , 薛向平 , 王邢燕 , 周彦锋 , 方弟安 , 徐东坡
2020, 27(5):589-597.
摘要:分析长江下游原良种场鳙()亲本和后备亲本的遗传多样性和遗传结构,评估鳙育种群体的种质资源现状,可为鳙的种质资源管理和活体资源库建设提供科学的参考依据。本研究利用已发表的10对SSR荧光引物结合毛细管电泳技术,对7个亲本群体和1个后备亲本群体共638份DNA进行基因分型。主要应用GenAlEx 6.501、Cervus 3.0和Structure 2.3.4等软件进行遗传多样性参数计算和群体遗传结构分析。结果表明,8个群体总体遗传多样性水平较高,但存在一定程度的近亲繁殖风险。其平均等位基因数(e)分别为0.76±0.05、0.82±0.02,Shannon's信息指数()为0.08±0.05。各亲本群体之间遗传多样性水平存在差异,后备亲本遗传多样性水平最高。鳙的贝叶斯群体遗传结构分析图(Structure)与主坐标分析(PCoA)结果具有一致性,将所有样本划分为两个类群,大部分亲本群体之间并无明显的遗传分化,而后备亲本和亲本之间则表现明显的遗传分化。分子方差分析(AMOVA)显示,11%的遗传变异来自群体间,群体间的遗传分化处于中等水平,而89%的遗传变异来自群体内。本研究探究了鳙亲本和后备亲本的遗传差异性,对野生原种引进和保护提供了建议,以期为构建健康负责的增殖放流种苗繁育体系提供理论支持和数据参考。
彭英林 , 刘慧敏 , 鄢庆枇 , 王玮 , 许净 , 郑江
2020, 27(5):598-604.
摘要:本研究采用核酸适配体的单链DNA浓度来表征其亲和力,通过测定核酸适配体与靶细菌哈维氏弧菌()结合后ssDNA的浓度,来研究该核酸适配体的亲和特异性和亲和常数,并通过荧光显微镜法对其亲和特异性进行验证。结果显示,采用单链DNA浓度法测得该核酸适配体对靶细菌哈维氏弧菌的亲和力是非目标菌的15.2倍以上;荧光显微镜直接观察发现只有靶细菌能较好结合有荧光标记的核酸适配体,并呈现明显荧光;荧光阻断法发现靶细菌和非靶细菌都未呈现明显荧光,证明了该适配体有较好的亲和特异性,也进一步验证了单链DNA法的测定结果。在亲和常数的测定方面,利用单链DNA浓度法测得该核酸适配体的亲和常数=0.960,有较好的准确性和可靠性,说明采用单链DNA浓度法来测定适配体的亲和力和亲和常数是可行的。