盐碱水中的高碳酸盐碱度是影响水生甲壳动物生存的重要因素之一。目前有关罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)对盐碱适应机制的研究鲜有报道。为探讨盐碱胁迫对罗氏沼虾存活、酶活性及转录表达的影响，本研究摸索了盐度和碳酸盐碱度对罗氏沼虾苗的半致死浓度(LC50)以及最低有影响浓度(LOEC)，探究了盐碱胁迫对罗氏沼虾幼苗鳃和肝胰腺中渗透调节和抗氧化相关酶活以及基因表达的影响。结果显示，盐度对罗氏沼虾虾苗的96 h-LC50=27.1，96 h-LOEC=16.5；碱度对罗氏沼虾虾苗的96 h-LC50=230.7 mg/L，96 h-LOEC=96.6 mg/L；并且盐碱交互作用表现出协同效应。罗氏沼虾幼苗鳃和肝胰腺中碱性磷酸酶(AKP)和钠钾腺苷三磷酸酶(Na?-K?-ATPase)活性随胁迫时间延长呈先降后升的趋势，鳃中钙腺苷三磷酸酶(Ca2?-ATPase)则呈现相反的变化趋势；肝胰腺中超氧化物歧化酶(SOD)活性在胁迫中期(72 h和120 h)达到最低水平，而过氧化氢酶(CAT)和谷胱甘肽S转移酶(GST)活性增加，碳酸酐酶(CA)活性在胁迫过程中呈现先降后升的趋势，但盐碱胁迫程度所产生的影响差异不显著；转录组分析揭示鳃和肝胰腺对盐碱胁迫的响应不同，鳃组织中涉及细胞外空间/区域(extracellular space/region)[例如四跨膜蛋白(tetraspanin)]、细胞对外源刺激响应(cellular response to xenobiotic stimulus)[脂肪醛脱氢酶(fatty aldehyde dehydrogenase)]、次级活性跨膜转运蛋白(secondary active transmembrane transporter)相关基因在盐碱胁迫下表达上调；盐碱胁迫抑制了肝胰腺的细胞外空间/区域相关基因表达，但促进了碳水化合物跨膜转运蛋白(carbohydrate transmembrane transporter)[类脂质运载蛋白(lipocalin-like protein)]相关基因表达上调，这表明罗氏沼虾可能通过协同的渗透压调节策略(包括增强腮的离子转运和提高肝胰腺的碳水化合物跨膜转运)来适应盐碱环境。本研究结果为揭示罗氏沼虾在盐碱环境中的适应机制提供科学依据。