研究表明，气候变化、渔业捕捞等因素会影响海洋生态系统的结构和功能。南海生态系统（South China Sea Ecosystem）作为大尺度海气相互作用最为敏感的区域之一，极易受到气候变化的影响。目前，有关南海生态系统响应气候变化的研究多数聚焦于物种层面，针对渔业生态系统的研究较少。因此，本研究利用南海渔业生态系统功能组和适温组的产量数据，系统分析南海渔业生态系统结构长期变化特征。结果表明，南海渔业生态系统跃变集中于20世纪80年代中期、90年代中期及21世纪10年代早期，较好地响应了该年代内的渔业捕捞现状。但渔业生态系统跃变的主要因素之一包括气候变化，在今后的研究中应该气候变化和渔业捕捞等因素相结合的基础上整体分析南海渔业生态系统结构变化的原因。进一步探究影响南海渔业生态系统变化的主导因素，为制定渔业管理政策提供依据。