肝细胞核因子4 (hepatocyte nuclear factor 4, HNF4)是长链多不饱和脂肪酸(long-chain polyunsaturated fatty acid, LC-PUFA)生物合成的重要转录因子。本研究使用RACE技术克隆中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)Hnf4基因, qPCR检测Hnf4基因在多个组织中的表达情况, 并通过RNA干扰、添加其抑制剂和激动剂处理后分析脂质代谢相关基因的表达变化。结果显示, 中华绒螯蟹Hnf4基因全长3554 bp, 其中5?非编码区长度为569 bp, 3?非编码区为1179 bp, 开放阅读框为1806 bp, 编码601个氨基酸。HNF4蛋白总平均亲疏水性为?0.177, 推测HNF4蛋白为亲水性蛋白。同源性分析发现中华绒螯蟹HNF4与克氏原螯虾(Procambarus clarkii)、拟穴青蟹(Scylla paramamosain)、三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)等虾蟹类具有较高的序列同一性和氨基酸同源性, 且在系统进化树中与拟穴青蟹和三疣梭子蟹HNF4聚为一支。qPCR结果显示, Hnf4在多个组织中均有表达, 但在肝胰腺中表达最高。使用dsRNA干扰Hnf4基因的表达后, 中华绒螯蟹肝胰腺中Fas、Scd、Fad6、Fad9以及Elovl4基因的表达显著降低, Hsl基因表达显著上调(P<0.05); 注射抑制剂BI-6015与RNA干扰结果相似, 而注射激动剂Benfluorex得到了相反的结果, 这提示Hnf4基因对中华绒螯蟹的脂质代谢及LC-PUFA生物合成调控有一定作用。上述研究结果可以为进一步探究HNF4的生物特异性作用以及对中华绒螯蟹脂质代谢等生理调控机制提供参考。